Estandarización de protocol de extracción de adn genomico de Podocnemis expansa e testes con los marcadores rapd e issr
STANDARDIZATION OF PROTOCOL FOR DNA EXTRACTION OF Podocnemis expansa AND TESTS WITH RAPD AND ISSR MARKERS

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Autores

DEYLA PAULA OLIVEIRA

Mestre DIAS-OLIVEIRA

JAQUELINE DAS DORES

ADRIANA MALVASIO

OLIVEIRA-JUNIOR WALDESSE PIRAGÉ

Resumen

Este trabajo tuvo como objetivo comparar y estandarizar un protocolo eficiente para la extracción de ADN de fragmentos de tejido de Podocnemis expansa y evaluar el poder informativo de los marcadores moleculares RAPD e ISSR para el análisis de la estructura genética de la especie colectada en el  entorno del  parque Nacional do Araguaia, Tocantins, Brasil. El método de extracción fue estandarizado a partir de la evaluación de tres diferentes protocolos  permitiendo la obtención de ADN de buena calidad y en cantidad adecuada para las reacciones de RAPD e ISSR. La razón A de las muestras presentó un valor entre 1.8 a 2.3, indicando que estas presentan baja contaminación por proteínas y que los ADNs podrían ser utilizados para evaluar el poder informativo de los marcadores RAPD e ISSR. Los dos marcadores demostraron ser una herramienta eficiente para estudios genéticos de P. expansa

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Referencias

ARAS, S.; DURAN A.; YENILMEZ, G. 2003. Isolation of DNA for RAPD analysis from dry leaf material of some Hesperis L. specimens. Plant Molecular Biology Reporter 21:461a-461.

ESCALONA, T.; FÁ, J.E. 1998. Survival of nests of the terecay turtle (Podocnemis unifilis) in the Nichare-Tawadu Rivers, Venezuela. Journal of Zoology 244:303-312.

FERREIRA, M. E.; GRATTAPAGLIA, D. 1998. Introdução ao uso de marcadores moleculares em análise genética. 3. ed. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, Brasil.

GALVÃO, S.B. 2007. Aspectos da biologia, criações comerciais e do consumo de quelônios no estado do Tocantins: alternativas de manejo e sustentabilidade. 2007. Monografia Bacharel em Engenharia Ambiental. Universidade Federal do Tocantins, Brasil.

GUPTA, M.; CHYI, Y.S.; ROMERO-SEVERSON, J.; OWEN, J.L. 1994. Amplification of DNA markers from evolutionarily diverse genomes using single primer of simple sequence repeats. Theor. Appl. Genet. 89:998-1006.

INNIS, M.A.; GELFAND, D.H.; SNINSKY, J.J.; WHITE, T.J. 1990. PCR protocols: a guide to methods and applications. Academic Press, San Diego, USA.

INSTITUTO BRASILEIRO DO MEIO AMBIENTE E DOS RECURSOS
NATURAIS RENOVAVEIS-IBAMA. 1989. Projetos Quelônios da Amazônia: Manual Técnico-BAMA. Brasília, Brasil.

LACERDA, D.R.; ACEDO, M.D.P.; LEMOS-FILHO, J.P.; LOVATO, M.B. 2002. A técnica de RAPD: uma ferramenta molecular em estudos de conservação de plantas. Lundiana 3(2):87-92.

LUZ, V.L.F. 2005. Criação comercial de tartaruga e tracajá: manual técnico. SEBRAE. Cuiabá; Brasil

MALVASIO, A; SALERA-JUNIOR, G. 2004. Entrevista com a equipe do Projeto Quelônios da Ilha do Bananal. Terras indígenas e Unidades de Conservação da Natureza, Brasil.

PECCININI-SEALE, D. 2002. Técnicas citogenéticas, enzimáticas e moleculares. Em: Técnicas de coleta e preparação de vertebrados. São Paulo: Arujá Instituto Pau Brasil de História Natural, Brasil.

PEZZUTI, J.C.B. 2003. Ecologia e Etnoecologia de Quelônios no Parque Nacional do Jaú, Amazonas, Brasil. Tese, Universidade Estadual de Campinas, São Paulo, Brasil.

PRITCHARD, P.C.H.; TREBBAU, P. 1984. The Turtles of Venezuela. S.1p. Society for the Study of Amphibians and Reptiles. USA.

PORTELINHA, T.C.G. 2007. Estudo das populações de Podocnemis expansa e Podocnemis unifilis no Rio Javaés, Tocantins. Monografia Bacharel em Engenharia Ambiental. Universidade Federal do Tocantins, Brasil.

REDDY, M.P.; SARLA, N.; SIDDIQ, E.A. 2002. Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application inplant breeding. Euphytica 128:9-17.

SAMBROOK, J.; FRITSCHI, E.F.; MANIATIS, T. 1989. Molecular cloning: a laboratory manual. New York Cold Spring Harbor Laboratory Press, USA.

SALERA-JUNIOR, G.; MALVASIO, A.; PORTELINHA, T.C.G. 2009. Avaliação de padrão irregular dos escudos do casco em Podocnemis expansa e Podocnemis unifilis (Testudines, Podocnemididae). Acta Amazonica 39(2):429436.

SALERA-JUNIOR, G.; MALVASIO, A.; GIRALDIN, O. 2006. Relações cordiais. Ciência Hoje 39(226):61-63.

TSUMURA,Y.; OHBA, K.; STRAUSS, S.H. 1996. Diversity and inheritance of inter-simple sequence repeat polymorphisms in Douglasfir (Pseudotsuga menziesii) and sugi (Cryptomeria japonica). Theor Appl Genet. 92:40-45.

ROMANO, E.; BRASILEIRO, A.C.M. 1999. Extração de DNA de plantas. Biotecnologia 2(9):40-43.

WEEDEN, N.F., TIMMERMAN., G.M.; HEMMAT, M.; KNEEN, B.E., LODHI, M. A. 1992. Inheritance and reliability of RAPD markers. Págs: 12-17. Em: Applications of RAPD technology to plant breeding, Joint Plant Breeding. Symposia Series, Minneapolis, USA.

WELSH, J.; McCLELLAND, M. 1990. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nucleic Acids Res. 18: 7213-7218.

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