Desarrollo y evaluación de Primers para detectar el gen protamina 3 en alpacas
Development and evaluation of Primers to detect the protamine 3 gene in alpacas
Contenido principal del artículo
Resumen
Objetivo. Desarrollar y evaluar primers para detectar el gen Protamina 3 (PRM3) en alpacas. Materiales y métodos. Los primers candidatos se diseñaron en base a las secuencias conservadas obtenidas del alineamiento del gen protamina 3 (PRM3) con la secuencia predicted del ARNm, ambos presentes en la base de datos del NCBI. Para la evaluación in silico, se enfrentaron los primers con el genoma de alpaca, y para la evaluación in vitro, se emplearon 51 muestras de tejido testicular. Resultados. Se obtuvieron 10 pares de primers. De estos, se seleccionaron los pares 1 y 6; denominados PRM3-P31 y PRM3-P32 y con amplicones de 240 pb y 328 pb, respectivamente. Además, la evaluación de subproductos se realizó mediante el programa Oligoanalyzer. Conclusiones. Se concluyó que el primer PRM3-P31 nos permite determinar la presencia del gen más seguridad que el otro primer seleccionado. Por lo tanto, fue posible desarrollar y evaluar primers para detectar la presencia del gen de la protamina 3 en alpacas.
Descargas
Detalles del artículo
Referencias / Ver
García W, Ccana E, Apaza E. Manual de empadre controlado de alpacas. Soluciones prácticas-ITDG. 2009. http://www.funsepa.net/soluciones/pubs/Mzcy.pdf
Muchotrigo D, Trelles X, Olazábal J, Choez K, Evangelista S, Santiani A. Probability of obtaining alpaca semen using an artificial vagina in groups of males without training. Spermova. 2013; 3(1):94–96. http://spermova.pe/site/files/revista%202013%20vol.3%20No.%201/95-96-24-Muchotrigo_-_Alpacas.pdf
Kizilay F, Altay BB, Kızılay F, Altay BB. Sperm function tests in clinical practice. Turk J Urol. 2017; 43(434):393–400. https://doi.org/10.5152/tud.2017.96646 DOI: https://doi.org/10.5152/tud.2017.96646
Nyberg KG, Carthew RW. Out of the testis: biological impacts of new genes. Genes Dev. 2017; 31:1825–1826. https://doi.org/10.1101/gad.307496.117. DOI: https://doi.org/10.1101/gad.307496.117
Jodar M, Soler-Ventura A, Oliva R. Semen proteomics and male infertility. J Proteomics. 2017; 162:125–134. https://doi.org/10.1016/j.jprot.2016.08.018 DOI: https://doi.org/10.1016/j.jprot.2016.08.018
Hamilton T, Simoes R, Mendes M, Goissis MD, Nakajima E, Martins E, et al. Detection of protamine 2 in bovine spermatozoa and testicles. Andrology. 2019; 7:373–381. https://doi.org/10.1111/andr.12610 DOI: https://doi.org/10.1111/andr.12610
Moore SS. Sperm protamine deficiency correlates with sperm DNA damage in Bos indicus bulls. Andrology. 2014; 2:370–378. https://doi.org/10.1111/j.2047-2927.2014.00196.x. DOI: https://doi.org/10.1111/j.2047-2927.2014.00196.x
Ribas-Maynou J, Benet J. Single and double strand sperm DNA damage: Different reproductive effects on male fertility. Genes. 2019; 10(2). https://doi.org/10.3390/genes10020105 DOI: https://doi.org/10.3390/genes10020105
Kadivar A, Shams Esfandabadi N, Dehghani Nazhvani E, Shirazi A, Ahmadi E. Effects of cryopreservation on stallion sperm protamine messenger RNAs. Reprod Domest Anim. 2020;55(3):274–82. https://doi.org/10.1111/rda.13615 DOI: https://doi.org/10.1111/rda.13615
Martin-Coello J, Gomendio M, Roldan ERS. Protamine 3 shows evidence of weak, positive selection in mouse species (genus Mus) - But it is not a protamine. Biol Reprod. 2011; 84(2):320–326. https://doi.org/10.1095/biolreprod.110.086454 DOI: https://doi.org/10.1095/biolreprod.110.086454
Kumar S, Singh U, Ganguly I, Rajib D, Rani S, Sandeep M, et al. Protamine 3 expressions in crossbred bull spermatozoa may not be a prognostic marker for differentiating good and poor quality semen. Afr. J. Biotechnol. 2014; 13(20):1999–2003. https://doi.org/10.5897/ajb2013.13535 DOI: https://doi.org/10.5897/AJB2013.13535
Abraham MC, Puhakka J, Ruete A, Al-Essawe EM, VerdierK., Morrell JM, Båge R. Testicular length as an indicator of the onset of sperm production in alpacas under Swedish conditions. Acta Vet Scand. 2016; 58(1). https://doi.org/10.1186/s13028-016-0191-x DOI: https://doi.org/10.1186/s13028-016-0191-x
Zamzami RS, Akmal M, Helmi TZ, Rusli R, SugitoS., Siregar TN, Wahyuni S. Identification and Characterization of Protamine 3 (prm3) Gene in Aceh Bull Testis. Adv. Biol. Res. In Icvaes 2020. 2021; 12(1):145–148. https://doi.org/10.2991/absr.k.210420.031 DOI: https://doi.org/10.2991/absr.k.210420.031
Orozco-Ugarriza M, Franco-Anaya P, Olivo-Martinez Y. Validación In silico de oligonucleótidos-primers para la detección especifica de Salmonella spp. mediante reacción en cadema de la polimerasa. RIADS. 2016; 1:42–50. http://revistas.sena.edu.co/index.php/riads/article/view/703.