Secuencias del gen mitocondrial para identificación de especies de animales

Mitochondrial gene sequences for identification of animal species

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JOYCE AZAMBUJA DE OLIVEIRA,
Programa de Pós-Graduação em Biologia Geral/Bioprospecção, Universidade Federal da Grande Dourados, Rodovia Dourados-Itahum, Km 12, Dourados - MS, 79804-970
BRUNO DO AMARAL CRISPIM
Faculdade de Ciências Biológicas e Ambientais, Universidade Federal da Grande Dourados, Rodovia Dourados-Itahum, Km 12, Dourados - MS, 79804-970.
NAYARA MORENO MARTINS
Programa de Pós-Graduação em Biologia Geral/Bioprospecção, Universidade Federal da Grande Dourados, Rodovia Dourados-Itahum, Km 12, Dourados - MS, 79804-970.
ALESSANDRA OLIVEIRA DA SILVA
Programa de Pós-Graduação em Biologia Geral/Bioprospecção, Universidade Federal da Grande Dourados, Rodovia Dourados-Itahum, Km 12, Dourados - MS, 79804-970.
PRISCILA LEOCÁDIA ROSA DOURADO
Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia Ambiental, Universidade Federal da Grande Dourados, Rodovia Dourados-Itahum, Km 12, Dourados - MS, 79804-970.
MONYQUE PALAGANO DA ROCHA,
Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia Ambiental, Universidade Federal da Grande Dourados, Rodovia Dourados-Itahum, Km 12, Dourados - MS, 79804-970.
ALEXÉIA BARUFATTI GRISOLIA
Faculdade de Ciências Biológicas e Ambientais, Universidade Federal da Grande Dourados, Rodovia Dourados-Itahum, Km 12, Dourados - MS, 79804-970.

Resumen

Marcadores moleculares basados en el ADN mitocondrial (ADNmt) tienen herencia materna y se pueden utilizar para evaluar relaciones filogenéticas y taxonómicas. El diagnóstico de similaridad en los seres vivos se puede lograr mediante análisis genómico del ARN ribosomal 16S (16S rARN). El objetivo de este estudio fue evaluar el potencial de marcador molecular en el16S ARNr como una metodología para la identificación de las diferentes especies de animales y determinar el grado de similitud genética entre estos individuos. Para ello, el ADN se extrajo a partir de 13 animales, 5 ovinos, 4 bovinos y 4 peces, a continuación se amplificaron, se purificaron y se secuenciaron las muestras. Los análisis de las secuencias se realizaron en los programas MEGA 5.10 y BLAST. Las secuencias identificadas en GenBank® mostraron que los animales pertenecían a las espécies Ovis aries (ovino), Bos taurus (bovino), Prochilodus lineatus (curimba) Pseudoplatystoma corruscans (pintado), Pseudoplatystoma reticulatum (cachara) y Leporinus obtusidens (piau). La distancia genética entre los diferentes grupos de animales fue de 0,10 bovinos/ovinos, 0,66 bovinos/peces y 0,65 ovinos/peces. La construcción del árbol filogenético ha determinado dos clases distintas siendo Mammalia, que contiene las subfamilias: Bovinae y Caprinae, y Actinopterygii que contiene las órdenes: Caraciforme (curimba y piau) y Siluriforme (pintado y cachara). La tecnología de los marcadores moleculares del ADNmt demonstró la posibilidad de utilizarla como herramienta en la identificación y diferenciación de las especies asistiendo a la obra de los taxonomistas. Por lo tanto, la secuenciación parcial de la región del gen 16S rARN fue suficiente para la identificación de ovinos, bovinos y diferentes especies de peces sobre la base de la similitud del gen en programa BLAST.

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Referencias (VER)

BENSON, D.A.; CAVANAUGH, M.; CLARK, K.; KARSCH-MIZRACHI, I.; LIPMAN, D.J.; OSTELL, J.; SAYERS, E.W. 2012. GenBank. Nucleic Acids Research 41:36–42.

BOLZAN, A. R. 2011. DNA barcode de Drosofilídeos micófagos pertencentes ao gênero Hirtodrosophila, Mycodrosophila e Zigothrica. Universidade Federal da Santa Maria. Santa Maria, Brasil.

CARVALHO, D.C. 2008. Identificação molecular de peixes: o caso do Surubim (Pseudoplatystoma spp.). Revista Brasileira de Reprodução Animal 258:215– 219.

CHUEIRE, L.M.O.; BANGEL, E.V.; MOSTASSO, F.L.; CAMPO, R.J.; PEDROSA, F.O.; HUNGRIA, M. 2003. Classificação taxonômica das estirpes de rizóbio recomendadas para as culturas da soja e do feijoeiro baseada no sequenciamento do gene 16S rRNA. Revista Brasileira de Ciência do Solo 1027:833–840.

CRISPIM, B.A.; SANTOS, D.B.S.; BANARI, A.C.; SENO, L.O.; GRISOLIA, A.B. 2012. Discriminação alélica em ovinos naturalizados do Pantanal Sul- Matogrossense por meio de marcadores microssatélites. Journal of the Selva Andina Research Society 3:3–13.

DAMINELI, A.; DAMINELI, D.S.C. 2007. Origens da vida. Estudos Avançados (USP, Impresso) 21:263–284.

GIROTTO, A.; ZANGIRÓLOMO, A.F.; BOGADO, A.L.G.; SOUZA, A.S.L.; SILVA, G.CF.; GARCIA, J.L.; VILAS BOAS, L.A.; BIONDO, A.W.; VIDOTTO, O. 2012. Molecular detection and occurrence of ‘Candidatus Mycoplasma haemobos’ in dairy cattle of Southern Brazil. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária 21(3):342–344.

HEBERT, P. D. N.; CYWINSKA, A.; BALL, S. L.; DEWAARD, J. R. 2003a. Biological identifications through DNA barcodes. Proceedings of the Royal Society of London, Series B 270:313–322.

HEBERT, P. D. N.; RATNASINGHAM, S.; DEWARD, J. R. 2003b. Barcoding animal life: cytochrome c oxidase subunit 1 divergences among closely related species. Proceedings of the Royal Society - Biological Sciences (Series B) 270:96–99.

LARKIN, M.A.; BLACKSHIELDS, G.; BROWN, N.P.; CHENNA, R.; McGETTIGAN, P.A.; McWILLIAN, H.; VALENTIN, F.; WALLACE, L.M.; WILM, A.; LOPEZ, R.; THOMPSON, J.D.; GIBSON, T.J.; HIGGINS, D.G. 2007. Clustal W and Clustal X version 2.0. Bioinformatics 23:2947–2948.

MEYER, A. 1994. Shortcomings of the cytochrome b gene as a molecular marker. Trends in Ecology & Evolution 9(8):278–280.

OLSON, Z. H.; WHITTAKER, D. G.; RHODES JR, O. E. 2009. The use of molecular markers in wild sheep research in North America: a review. Proceeding of the Northern Wild Sheep and Goat Council Biennial Symposium 16:251–269.

ORREGO, L.E.O. 2012. Análise filogeográfica de Brachyplatystoma platynemum (Siluriformes: Pimelodidae). Universidade Estadual Paulista. Botucatu, Brasil.

PALUMBI, S.R. 1996. Nucleic acids II: the polymerase chain reaction. Págs. 205-247 em: Hillis, D.M.; Moritz, C.; Mable, B.K. (eds), Molecular Systematics. Sinauer & Associates Inc., Sunderland, Massachusetts, USA.

SHOUCHE, Y.S.; PATOLE, M.S. 2000. Sequence analysis of mitochondrial 16S ribosomal RNA gene fragment from seven mosquito species. Journal of Biosciences 25(4):361–366.

SILVA, S.A.; KAVALCO, K.F.; PAZZA, R. 2012. Uso do sequenciamento de genes mitocondriais na identificação de files de salmão. Evolução e Conservação da Biodiversidade 3(2):64–67.

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